Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CRXO43186 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CRXO43186 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRXO43186 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRXO43186 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRXO43186 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRXO43186 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRXO43186 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRXO43186 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRXO43186 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRXO43186 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRXO43186 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRXO43186 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRXO43186 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRXO43186 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRXO43186 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRXO43186 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRXO43186 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRXO43186 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRXO43186 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRXO43186 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRXO43186 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRXO43186 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRXO43186 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRXO43186 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRXO43186 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRXO43186 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRXO43186 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRXO43186 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRXO43186 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRXO43186 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRXO43186 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRXO43186 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRXO43186 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRXO43186 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRXO43186 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRXO43186 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRXO43186 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRXO43186 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRXO43186 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRXO43186 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRXO43186 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRXO43186 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRXO43186 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRXO43186 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRXO43186 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRXO43186 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRXO43186 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRXO43186 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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