Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN3O15551 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN3O15551 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN3O15551 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN3O15551 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN3O15551 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN3O15551 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN3O15551 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN3O15551 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN3O15551 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN3O15551 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN3O15551 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN3O15551 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN3O15551 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN3O15551 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN3O15551 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN3O15551 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN3O15551 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN3O15551 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN3O15551 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN3O15551 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN3O15551 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDN3O15551 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDN3O15551 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDN3O15551 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDN3O15551 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDN3O15551 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDN3O15551 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN3O15551 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
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