Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GNPATO15228 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GNPATO15228 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GNPATO15228 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GNPATO15228 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GNPATO15228 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GNPATO15228 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GNPATO15228 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GNPATO15228 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GNPATO15228 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GNPATO15228 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GNPATO15228 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GNPATO15228 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GNPATO15228 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GNPATO15228 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GNPATO15228 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GNPATO15228 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GNPATO15228 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GNPATO15228 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GNPATO15228 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GNPATO15228 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GNPATO15228 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GNPATO15228 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GNPATO15228 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNPATO15228 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNPATO15228 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNPATO15228 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNPATO15228 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNPATO15228 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNPATO15228 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNPATO15228 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNPATO15228 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNPATO15228 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNPATO15228 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNPATO15228 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNPATO15228 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNPATO15228 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNPATO15228 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNPATO15228 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNPATO15228 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNPATO15228 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNPATO15228 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNPATO15228 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNPATO15228 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNPATO15228 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNPATO15228 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNPATO15228 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNPATO15228 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNPATO15228 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNPATO15228 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNPATO15228 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNPATO15228 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GNPATO15228 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GNPATO15228 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNPATO15228 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNPATO15228 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNPATO15228 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNPATO15228 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GNPATO15228 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GNPATO15228 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GNPATO15228 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GNPATO15228 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GNPATO15228 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GNPATO15228 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GNPATO15228 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GNPATO15228 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GNPATO15228 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GNPATO15228 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GNPATO15228 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GNPATO15228 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GNPATO15228 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GNPATO15228 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GNPATO15228 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GNPATO15228 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GNPATO15228 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GNPATO15228 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GNPATO15228 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GNPATO15228 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GNPATO15228 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GNPATO15228 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GNPATO15228 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GNPATO15228 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GNPATO15228 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GNPATO15228 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GNPATO15228 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GNPATO15228 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GNPATO15228 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GNPATO15228 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GNPATO15228 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GNPATO15228 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GNPATO15228 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GNPATO15228 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GNPATO15228 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GNPATO15228 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GNPATO15228 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GNPATO15228 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GNPATO15228 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GNPATO15228 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GNPATO15228 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GNPATO15228 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms