Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASKO14936 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASKO14936 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASKO14936 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASKO14936 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASKO14936 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASKO14936 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASKO14936 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CASKO14936 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASKO14936 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASKO14936 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASKO14936 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASKO14936 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASKO14936 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASKO14936 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASKO14936 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASKO14936 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASKO14936 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASKO14936 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASKO14936 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASKO14936 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASKO14936 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASKO14936 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASKO14936 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASKO14936 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASKO14936 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASKO14936 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASKO14936 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASKO14936 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASKO14936 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASKO14936 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASKO14936 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASKO14936 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASKO14936 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASKO14936 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASKO14936 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASKO14936 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASKO14936 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASKO14936 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASKO14936 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASKO14936 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASKO14936 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASKO14936 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASKO14936 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASKO14936 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASKO14936 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASKO14936 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASKO14936 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASKO14936 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASKO14936 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASKO14936 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASKO14936 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASKO14936 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASKO14936 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASKO14936 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASKO14936 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASKO14936 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASKO14936 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASKO14936 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASKO14936 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASKO14936 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CASKO14936 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms