Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms