Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F3O00716 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F3O00716 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F3O00716 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F3O00716 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F3O00716 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F3O00716 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F3O00716 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F3O00716 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F3O00716 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F3O00716 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F3O00716 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F3O00716 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F3O00716 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F3O00716 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F3O00716 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F3O00716 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F3O00716 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F3O00716 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F3O00716 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F3O00716 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F3O00716 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F3O00716 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F3O00716 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F3O00716 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F3O00716 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F3O00716 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F3O00716 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F3O00716 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F3O00716 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F3O00716 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F3O00716 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F3O00716 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F3O00716 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F3O00716 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F3O00716 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F3O00716 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F3O00716 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F3O00716 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F3O00716 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F3O00716 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F3O00716 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F3O00716 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F3O00716 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F3O00716 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F3O00716 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F3O00716 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F3O00716 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F3O00716 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F3O00716 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F3O00716 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F3O00716 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F3O00716 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F3O00716 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2F3O00716 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F3O00716 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F3O00716 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F3O00716 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F3O00716 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F3O00716 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F3O00716 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F3O00716 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F3O00716 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F3O00716 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F3O00716 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F3O00716 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F3O00716 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F3O00716 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F3O00716 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F3O00716 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms