Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGRNO00468 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGRNO00468 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
AGRNO00468 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
AGRNO00468 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGRNO00468 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGRNO00468 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGRNO00468 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGRNO00468 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGRNO00468 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGRNO00468 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGRNO00468 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGRNO00468 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGRNO00468 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGRNO00468 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGRNO00468 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGRNO00468 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGRNO00468 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGRNO00468 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGRNO00468 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
AGRNO00468 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGRNO00468 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGRNO00468 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGRNO00468 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGRNO00468 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGRNO00468 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGRNO00468 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGRNO00468 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGRNO00468 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGRNO00468 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGRNO00468 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGRNO00468 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGRNO00468 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGRNO00468 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGRNO00468 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGRNO00468 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGRNO00468 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
AGRNO00468 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
AGRNO00468 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGRNO00468 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGRNO00468 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGRNO00468 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGRNO00468 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGRNO00468 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGRNO00468 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGRNO00468 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGRNO00468 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGRNO00468 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGRNO00468 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGRNO00468 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGRNO00468 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
AGRNO00468 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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AGRNO00468 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGRNO00468 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGRNO00468 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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AGRNO00468 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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AGRNO00468 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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AGRNO00468 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
AGRNO00468 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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AGRNO00468 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
AGRNO00468 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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AGRNO00468 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AGRNO00468 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AGRNO00468 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AGRNO00468 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AGRNO00468 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AGRNO00468 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AGRNO00468 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
AGRNO00468 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AGRNO00468 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
AGRNO00468 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
AGRNO00468 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
AGRNO00468 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
AGRNO00468 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
AGRNO00468 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
AGRNO00468 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRNO00468 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRNO00468 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRNO00468 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRNO00468 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRNO00468 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRNO00468 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRNO00468 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRNO00468 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRNO00468 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRNO00468 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRNO00468 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRNO00468 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRNO00468 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRNO00468 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRNO00468 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRNO00468 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRNO00468 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AGRNO00468 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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