Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DFFAO00273 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DFFAO00273 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DFFAO00273 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DFFAO00273 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DFFAO00273 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DFFAO00273 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DFFAO00273 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DFFAO00273 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DFFAO00273 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DFFAO00273 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DFFAO00273 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DFFAO00273 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DFFAO00273 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DFFAO00273 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DFFAO00273 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DFFAO00273 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DFFAO00273 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DFFAO00273 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DFFAO00273 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DFFAO00273 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DFFAO00273 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DFFAO00273 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DFFAO00273 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DFFAO00273 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DFFAO00273 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DFFAO00273 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DFFAO00273 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DFFAO00273 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DFFAO00273 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DFFAO00273 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DFFAO00273 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DFFAO00273 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DFFAO00273 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DFFAO00273 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DFFAO00273 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DFFAO00273 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DFFAO00273 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DFFAO00273 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DFFAO00273 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DFFAO00273 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DFFAO00273 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DFFAO00273 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DFFAO00273 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DFFAO00273 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DFFAO00273 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DFFAO00273 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DFFAO00273 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DFFAO00273 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DFFAO00273 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DFFAO00273 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DFFAO00273 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DFFAO00273 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DFFAO00273 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DFFAO00273 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DFFAO00273 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DFFAO00273 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DFFAO00273 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DFFAO00273 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DFFAO00273 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DFFAO00273 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DFFAO00273 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DFFAO00273 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DFFAO00273 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DFFAO00273 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DFFAO00273 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DFFAO00273 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DFFAO00273 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DFFAO00273 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DFFAO00273 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DFFAO00273 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DFFAO00273 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DFFAO00273 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DFFAO00273 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DFFAO00273 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DFFAO00273 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DFFAO00273 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DFFAO00273 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DFFAO00273 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DFFAO00273 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DFFAO00273 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DFFAO00273 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DFFAO00273 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DFFAO00273 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DFFAO00273 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DFFAO00273 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DFFAO00273 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DFFAO00273 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DFFAO00273 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DFFAO00273 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DFFAO00273 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DFFAO00273 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DFFAO00273 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DFFAO00273 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DFFAO00273 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DFFAO00273 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DFFAO00273 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
DFFAO00273 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DFFAO00273 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DFFAO00273 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms