Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms