Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms