Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms