Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRDCB7Z8K6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms