Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms