Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
HACD1B0YJ81 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HACD1B0YJ81 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms