Protein–RNA interactions for Protein: A8K830

COLCA2, Colorectal cancer-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA2A8K830 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COLCA2A8K830 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COLCA2A8K830 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms