Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TVP23AA6NH52 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23AA6NH52 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23AA6NH52 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23AA6NH52 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23AA6NH52 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23AA6NH52 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23AA6NH52 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23AA6NH52 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23AA6NH52 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23AA6NH52 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TVP23AA6NH52 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23AA6NH52 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23AA6NH52 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23AA6NH52 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23AA6NH52 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23AA6NH52 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23AA6NH52 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23AA6NH52 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23AA6NH52 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TVP23AA6NH52 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms