Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC182A6NF36 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC182A6NF36 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms