Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LAMB4A4D0S4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms