Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 DIP2C-202ENST00000381496 7749 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CPS1P31327 AL627309.1-201ENST00000466430 2748 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CPS1P31327 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CPS1P31327 AC023283.1-201ENST00000453491 4897 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CPS1P31327 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CPS1P31327 MFSD6-201ENST00000281416 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CPS1P31327 DDX21-201ENST00000354185 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CPS1P31327 LAMA1-201ENST00000389658 9657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CPS1P31327 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CPS1P31327 AGAP1-207ENST00000428334 10090 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CPS1P31327 SERPIND1-201ENST00000215727 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CPS1P31327 TNPO3-201ENST00000265388 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CPS1P31327 CXCR2P1-201ENST00000439871 2503 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CPS1P31327 TMEM209-206ENST00000473456 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CPS1P31327 OR4K17-202ENST00000641386 4886 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CPS1P31327 PIGN-231ENST00000639174 4095 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 OPTN-203ENST00000378748 3521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 Z83313.1-201ENST00000433780 718 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 NSRP1-205ENST00000479218 540 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 CYFIP2-209ENST00000521420 6370 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 AL356800.1-201ENST00000553339 735 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 SUPT4H1-207ENST00000581540 668 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 ERVFRD-1-202ENST00000542862 3184 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 RPL12P38-202ENST00000588627 2319 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 PIWIL2-204ENST00000521356 3488 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 LINC00310-204ENST00000430922 2086 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 ARID2-201ENST00000334344 8642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 ZNRD1ASP-211ENST00000376797 3270 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 MYH8-201ENST00000403437 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 AC110048.2-201ENST00000617013 6721 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 DDHD1-210ENST00000612692 12339 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 ANKS1B-215ENST00000549493 3328 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 FBN2-208ENST00000619499 10154 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 SORBS1-204ENST00000361941 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 ZNF2-204ENST00000617923 3885 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 AC004988.1-201ENST00000415237 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 ANKFY1-209ENST00000574367 5033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 NOTCH2NL-203ENST00000578207 5042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 AC090132.1-201ENST00000524071 1480 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CPS1P31327 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 RPSAP7-201ENST00000456871 885 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 SKA2-207ENST00000583380 583 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 AC097381.3-201ENST00000608962 462 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 ZNF667-206ENST00000591790 5250 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 AC092999.1-201ENST00000624004 1924 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 KANK1-205ENST00000382297 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 SIDT2-219ENST00000620360 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 ATG13-207ENST00000526508 4199 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 OIP5-AS1-201ENST00000500949 8829 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 CNTN4-201ENST00000397459 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 MTIF2-203ENST00000394600 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 GALNT15-206ENST00000617544 2775 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 PITRM1-AS1-201ENST00000430356 3998 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 PPP2R5C-218ENST00000556260 2013 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 SRGAP2B-204ENST00000612199 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 SMIM2-201ENST00000400419 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 AC009500.1-201ENST00000420684 583 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CPS1P31327 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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