Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 LARP7-201ENST00000324052 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 LTBP1-202ENST00000404525 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 CNTN4-201ENST00000397459 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 NLK-201ENST00000407008 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC135012.3-201ENST00000599841 4039 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 SLC7A2-204ENST00000494857 7622 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 NCR3LG1-201ENST00000338965 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 HPSE2-204ENST00000404542 3681 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AL080312.1-201ENST00000256654 824 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 VPREB1-201ENST00000302273 626 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP25-201ENST00000362449 308 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 PAGE5-202ENST00000374952 428 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 MAS1L-201ENST00000377127 1260 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 IGKV6D-41-201ENST00000390271 371 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 TRBV23OR9-2-201ENST00000390389 335 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 TPM3P4-201ENST00000425942 755 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 ATP5G1P5-201ENST00000429024 411 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AL162595.2-201ENST00000430677 792 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC092634.4-203ENST00000451395 448 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 PRMT8-203ENST00000452611 1204 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 GGTA1P-204ENST00000488429 1104 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL62P-201ENST00000498506 297 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 MYL5-205ENST00000505477 584 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC098827.1-201ENST00000514630 667 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AL158819.1-201ENST00000514681 398 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC144568.2-201ENST00000522481 944 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC103681.2-201ENST00000527450 567 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 PGA3-204ENST00000538258 867 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 PGA3-207ENST00000543125 968 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 PGA4-206ENST00000544899 867 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 LINC02373-201ENST00000549261 423 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 PCAT29-202ENST00000558941 545 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 LINC00663-206ENST00000589910 732 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC174071.1-201ENST00000603069 517 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC018737.1-201ENST00000603900 204 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AL109930.1-201ENST00000606932 724 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 TRBV10-3-201ENST00000611462 368 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.42-201ENST00000621081 348 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 DLSTP1-201ENST00000444241 1354 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 EHHADH-AS1-201ENST00000417720 1416 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 SYTL2-228ENST00000533892 1441 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 NFAT5-208ENST00000566899 4914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 LINC01924-201ENST00000589376 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 GATAD2B-203ENST00000634408 1825 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 MTIF2-203ENST00000394600 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D31-202ENST00000327098 2985 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 ZMYND8-201ENST00000262975 4139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 MAPK10-298ENST00000641297 3040 ntAPPRIS P2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC009148.1-201ENST00000570148 2693 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 TMEM59-204ENST00000371344 2473 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC055716.2-201ENST00000552545 2441 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 PTBP3-205ENST00000374257 7240 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 CDC25C-201ENST00000323760 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 EFCAB1-201ENST00000262103 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 EXOSC9-211ENST00000512454 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 MFSD8-243ENST00000641695 1455 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 ELAVL4-201ENST00000357083 1442 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC008543.2-201ENST00000436907 1383 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 TFF1-201ENST00000291527 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 OR10J5-201ENST00000334857 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 OR11G2-201ENST00000357366 1038 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 APOM-202ENST00000375918 922 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC121338.1-201ENST00000380601 1287 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms