Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 C9orf72-206ENST00000619707 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 RSPH10B2-201ENST00000297186 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 RSPH10B-201ENST00000337579 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC008938.1-201ENST00000566929 6510 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 ACTR2-201ENST00000260641 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 CC2D2A-202ENST00000424120 5249 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 SPIN4-201ENST00000374884 4117 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 KDM4C-205ENST00000428870 3039 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 BRPF1-206ENST00000457855 4308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 ABCB4-203ENST00000359206 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 SYNJ1-206ENST00000433931 4852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 ATAD2-205ENST00000521903 5143 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 ALPK1-203ENST00000458497 5410 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 RPL36P1-201ENST00000419720 225 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC018804.1-201ENST00000430381 618 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 LINC01094-206ENST00000514130 594 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AP000893.2-201ENST00000527550 433 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 EAPP-205ENST00000618169 1237 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 CACNA1D-202ENST00000350061 7636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 WDR31-203ENST00000374195 3101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 SETD5-203ENST00000402198 6827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC091173.1-201ENST00000505627 2750 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 GATAD2B-203ENST00000634408 1825 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 ZNF557-202ENST00000414706 5736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 A2ML1-205ENST00000539547 3460 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 C2CD5-218ENST00000545552 3471 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC091013.1-201ENST00000499752 3734 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 MAPK10-228ENST00000512689 2583 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 CTSC-203ENST00000524463 6125 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 NUSAP1-210ENST00000560177 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 ZNF3-202ENST00000299667 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 USP31-201ENST00000219689 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 GRAMD2B-212ENST00000513040 2196 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC098850.4-201ENST00000448331 8802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC114980.1-201ENST00000505668 3157 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 ABCC5-205ENST00000427120 4697 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 NVL-211ENST00000469075 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 DDX24-211ENST00000640432 2580 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 MAPK10-244ENST00000639972 2818 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AL138930.1-201ENST00000446952 635 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AL390026.1-201ENST00000456647 457 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 SCARNA20.1-201ENST00000516009 138 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 BTF3P1-201ENST00000522014 495 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 MALAT1-208ENST00000616527 572 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 GIT2-205ENST00000457474 5291 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 MAPK10-248ENST00000640490 2715 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 SOSTDC1-202ENST00000396652 2411 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC010894.3-201ENST00000442996 2400 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 COL11A1-203ENST00000370096 7286 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 ZNF91-201ENST00000300619 5489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 EPYC-201ENST00000261172 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 TMCC1-AS1-204ENST00000605830 3496 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 OGDH-210ENST00000631326 4116 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 FAR2-202ENST00000536681 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 CSN2-201ENST00000353151 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 RPL5P34-201ENST00000426545 891 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 TEX46-202ENST00000566855 510 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AC097376.1-201ENST00000602907 997 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AL161729.2-201ENST00000605700 456 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 NPPA-AS1_1.1-201ENST00000622391 173 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PTPRMP28827 VPS36-201ENST00000378060 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms