Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
V9GY48 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
V9GY48 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
V9GY48 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
V9GY48 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
V9GY48 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
V9GY48 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
V9GY48 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
V9GY48 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
V9GY48 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
V9GY48 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
V9GY48 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
V9GY48 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
V9GY48 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
V9GY48 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
V9GY48 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
V9GY48 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
V9GY48 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GY48 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GY48 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GY48 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GY48 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GY48 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GY48 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GY48 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GY48 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GY48 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GY48 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GY48 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GY48 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GY48 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GY48 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GY48 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GY48 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GY48 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GY48 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GY48 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GY48 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GY48 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GY48 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GY48 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GY48 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GY48 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GY48 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GY48 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GY48 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
V9GY48 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
V9GY48 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
V9GY48 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
V9GY48 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
V9GY48 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
V9GY48 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
V9GY48 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
V9GY48 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
V9GY48 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
V9GY48 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
V9GY48 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
V9GY48 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
V9GY48 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
V9GY48 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
V9GY48 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
V9GY48 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
V9GY48 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
V9GY48 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
V9GY48 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
V9GY48 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
V9GY48 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
V9GY48 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
V9GY48 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GY48 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GY48 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GY48 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GY48 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GY48 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GY48 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GY48 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GY48 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GY48 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GY48 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GY48 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GY48 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GY48 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GY48 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GY48 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GY48 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GY48 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GY48 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GY48 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GY48 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GY48 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GY48 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GY48 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GY48 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GY48 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GY48 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
V9GY48 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
V9GY48 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
V9GY48 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
V9GY48 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
V9GY48 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms