Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms