Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRRAPQ9Y4A5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRRAPQ9Y4A5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms