Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
THRAP3Q9Y2W1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms