Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF5Q9Y2D1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF5Q9Y2D1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms