Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGSF9BQ9UPX0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGSF9BQ9UPX0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms