Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TNFSF18Q9UNG2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms