Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF346Q9UL40 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms