Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C4Q9UKN8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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