Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP21Q9UK80 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP21Q9UK80 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP21Q9UK80 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP21Q9UK80 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP21Q9UK80 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP21Q9UK80 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP21Q9UK80 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP21Q9UK80 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP21Q9UK80 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP21Q9UK80 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP21Q9UK80 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
USP21Q9UK80 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP21Q9UK80 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP21Q9UK80 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP21Q9UK80 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP21Q9UK80 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
USP21Q9UK80 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP21Q9UK80 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP21Q9UK80 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms