Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HACL1Q9UJ83 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms