Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SCN11AQ9UI33 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms