Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX20Q9UHI6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms