Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHORDC1Q9UHD1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHORDC1Q9UHD1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.7 ms