Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTNAP2Q9UHC6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms