Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC6Q9UBN7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms