Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms