Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP1Q9NZU7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CABP1Q9NZU7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms