Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD2Q9NZN4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms