Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms