Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
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