Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms