Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMOD3Q9NYL9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
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