Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DLL3Q9NYJ7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms