Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms