Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH4Q9NXW9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms