Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms