Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms