Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG3Q9NT62 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG3Q9NT62 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms